如何抵達東港搭船
自行開車
北部及中南部旅客，可經由國道一號高速公路南下，由小港機場出口沿省道十七號公路往東港行駛，即可抵達東港碼頭，再搭交通船至小琉球。也可直接導航搜尋：東琉線交通船聯營處。 華僑市場漁會旁有立體停車場，或是碼頭區域有私人停車場可以選擇。
大眾運輸
搭乘高鐵至高雄左營站，在二號出口有台灣好行售票櫃檯進行劃位，再下樓至客運第一月台搭乘「大鵬琉球線」 出發後第一站即是「東琉線碼頭站」。 可使用現金，但建議您選擇悠遊卡付費，享更多優惠。 搭乘航班可在小港國際機場轉搭國光、屏東、高雄客運至東港，再至東港碼頭，搭交通船到小琉球。
其他
在高雄火車站及高鐵左營站皆有私人共乘計程車可以搭乘，以人數計費，若同行友人多也可使用包車服務。
如何取票搭船
當天抵達東港之後可以看最接近的時間選擇船班，有東琉、泰富及藍白三間船公司，選擇一間即可（來回必須搭同一家），至民宿取票櫃檯告知為鹹腦袋潛水民宿的客人，並提供訂票人姓名電話與所有旅客的身分證件進行取票。在登船時也請準備好您的身份證以便海巡人員查驗資料喔，航程約20-25分鐘。
小琉球船班表
請注意：
1.船票為來回票券並會一次領到，請您仔細保管，若遺失無法補發喔!
2.船班會隨著淡旺季做彈性調整，請選好船公司後到該家船公司官網再次確認船班）
抵達小琉球後如何領機車
阿文租車行
從碼頭走到租車地方路程只要五分鐘，下船後請往賣船票的櫃檯方向走去，接著會看到櫃台旁有個階梯請往上走，到上面後請左轉會看到右前方有一間廟，面對廟的左手邊有個小徑走進去就是租機車的地方「小琉球阿文租車行」，請跟對方告知是「鹹腦袋潛水民宿」，並出示駕照不需付錢即可牽車。